可能です。

フォルダーごとに分類するには以下、１～３の設定が必要となります。
１．フォルダーの作成
２．フォームの移動
３．システム設定の変更

１．フォルダーの作成
　　分類するためのフォルダーを作成します。

　　1 ) 管理者権限を持つユーザーでワークフローシステムにログインします。
　　2 ) ヘッダメニュー [管理] - [コンテンツ管理] をクリックします。
　　3 ) サイドメニューの [フォルダー] をクリックし、[フォルダー] 画面を表示します。
　　4 ) [新しいフォルダー]ボタンをクリックし、[新しいフォルダー]画面を表示します。
　　5 ) [フォルダー名]項目に任意の名前を入力します。
　　6 ) [登録]ボタンをクリックします。

２．フォームの移動
　　各フォームを「１．フォルダーの作成」で作成したフォルダーに移動させます。

　　[申請フォーム一覧]画面でフォルダー毎に表示するには、「ワークフロー」ではなく
　　「フォーム」をフォルダーに移動する必要があります。

　　1 ) 管理者権限を持つユーザーでワークフローシステムにログインします。
　　2 ) ヘッダメニュー [管理] - [コンテンツ管理] をクリックします。
　　3 ) サイドメニューの [フォーム] をクリックし、[フォーム] 画面を表示します。
　　4 ) 任意のフォームのチェックボックスにチェックを入れ、[移動]ボタンをクリックします。
　　5 ) [フォルダーを選択]ダイアログにてフォームを移動させたいフォルダーを選択し、[OK]ボタンをクリックします。

　　※フォルダーへの移動は、フォームマネージャーで実施いただいても構いません。

３．設定の変更
　　フォーム一覧画面の表示をフォルダー分類するように変更します。
　　※一覧画面の表示方法が大きく変更となるため、一般ユーザーの利用が少ない時間帯の設定変更を推奨します。

　　1 ) 管理者権限を持つユーザーでワークフローシステムにログインします。
　　2 ) ヘッダメニュー [管理] - [システム設定] をクリックします。
　　3 ) サイドメニューの [申請・承認] をクリックし、[申請・承認] 画面を表示します。
　　4 ) [申請]タブの[申請フォーム一覧]にある[表示方法]設定を[フォルダーで分類]に変更します。
　　5 ) [保存]ボタンをクリックします。
　　6 ) [申請フォーム一覧]画面を表示し、「２．フォームの移動」で設定したフォルダー構成で
　　　 表示されているかご確認ください。